Les filtres HEPA sont utilisés dans de nombreux systèmes de filtration d'air, car ils recueillent 99,97% des microbes en suspension dans l'air, aussi petits que 0,01 à 0,3. Des exemples sont les spores de moisissure, le pollen, les squames d'animaux, les acariens et autres particules qui peuvent accentuer les allergies et les affections respiratoires.
Nettoyer régulièrement, une fois par mois est recommandé, mais il peut être nécessaire de le nettoyer plus souvent dans des environnements avec des animaux de compagnie ou dans un environnement champêtre. Pour le nettoyer, passez l'aspirateur sur le filtre avec l'accessoire portatif pour enlever la poussière et autres grosses particules. Le filtre HEPA peut être lavé en le faisant couler sous l'eau froide et frotté à l'aide d'une brosse à dents pour enlever doucement les particules. Le filtre HEPA doit être remplacé chaque année.